Ο ηλεκτρονικός φάκελος υγείας παρουσιάζει πλεονεκτήματα που έχουν σχέση με την υγεία του ασθενούς, σύμφωνα με τον πρόεδρο της Εθνικής Επιτροπής Βιοηθικής, κ. Χριστόδουλο Στεφανάδη, με την καλύτερη λειτουργία των δομών υγείας και με τον εξορθολογισμό των δαπανών. Ωστόσο, προβλήματα βιοηθικής, που ενδεχόμενα προκύπτουν, έχουν σχέση με το ιατρικό απόρρητο και γενικότερα με την προστασία των προσωπικών δεδομένων.
Ζήτημα προστασίας των ευαίσθητων δεδομένων ασθενών μπορεί να προκύψει και στην περίπτωση της δημοσιοποίησης της λίστας αναμονής χειρουργείων των δημόσιων νοσοκομείων, για λόγους διαφάνειας, που εξαγγέλθηκε πρόσφατα από το Υπουργείο Υγείας, αναφέρει η Επιτροπή. Όπως τονίζει, το θέμα είναι σοβαρό και περίπλοκο, καθώς η εξυπηρέτηση ενός αναμφισβήτητου στόχου δημόσιου συμφέροντος δεν πρέπει να θέτει σε κίνδυνο ευαίσθητες πληροφορίες που αφορούν τον πυρήνα της προσωπικότητας.